バイオインフォマティクスでゲノムワイド関連解析(GWAS)

バイオインフォマティクスを頑張っている方が、本ブログの内容を真似することで、自分のデータで解析ができる情報を提供することが目標です! 今はGATKの解説をメインテーマにしています。

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2021-06-20から1日間の記事一覧

バイオインフォマティクスのおすすめ書籍紹介

バイオインフォマティクス関連のおすすめ書籍を紹介します。 バイオインフォマティクスを勉強している中で、「参考になる本が知りたい!誰か教えて!」と思うことが頻繁にあります。専門的な分野なので書籍自体の数も多くない上に、Amazonのレビュー数も少な…

SNP情報の取得[Samtools mpileup]

Samtools mpileupの使い方 samtools, bcftools, vcftools BAMファイルから変異情報を記述したVCF (Variant Call Format)という形式のファイルをbuildします。全ゲノムスケールの様々な解析にはVCFファイルが前提となることが多いため、GWAS(ゲノムワイド関…