バイオインフォマティクスでゲノムワイド関連解析(GWAS)

バイオインフォマティクスを頑張っている方が、本ブログの内容を真似することで、自分のデータで解析ができる情報を提供することが目標です! 今はGATKの解説をメインテーマにしています。

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ロードマップ

RAxML-ngによるSNP系統解析の実践方法 [最尤法] [maximum likelihood]

主な使用ツール; RAxML-NG, Modeltest-NG, FigTree 使用難易度★★★☆☆ Produce an ML phylogeny by RAxML-NG@Harrykun_blog 今回は何をする? 前回の記事で取得したSNP情報を基に最尤法による系統解析を行います。 全ゲノムスケールのSNP情報を使用することで…

バイオインフォマティクスのロードマップ Part1

SRA形式からBAMファイル出力までのロードマップ 記事にした作業内容について、自分のメモとして作成している図表を時折アップしていきます。 覚書程度の内容です。 Twitterで記事の更新をお知らせしているので、興味を持たれた方は是非フォローをお願いしま…