バイオインフォマティクスでゲノムワイド関連解析(GWAS)

バイオインフォマティクスを頑張っている方が、本ブログの内容を真似することで、自分のデータで解析ができる情報を提供することが目標です! 今はGATKの解説をメインテーマにしています。

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2021-07-12から1日間の記事一覧

今後のGATK解析で使用するWGSデータの収集 -GATK解説シリーズ-part 2

sra-toolkit, fasterq-dump, sra-toolkit 導入難易度★☆☆☆☆ 使用難易度★★☆☆☆ 今回は何をする? 今後のGATK解析で使用するマラリア原虫のWGSデータを収集します。せっかくなので、以前のprefetchとは違うfasterq-dumpを使ったダウンロードの方法を紹介します。…