バイオインフォマティクスでゲノムワイド関連解析(GWAS)

バイオインフォマティクスを頑張っている方が、本ブログの内容を真似することで、自分のデータで解析ができる情報を提供することが目標です! 今はGATKの解説をメインテーマにしています。

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2021-06-14から1日間の記事一覧

リファレンスゲノムへのマッピング [BWA]

BWAの使い方。 bwa mem, samtools sort, samtools index これまでに準備したファイルを使って、BWAを用いたリファレンスゲノムへのWGSデータのマッピングを行います。 今回使う主なコマンドは 1. bwa mem 2. samtools sort 3. samtools index の3つ。 Twitt…