バイオインフォマティクスでゲノムワイド関連解析(GWAS)

バイオインフォマティクスを頑張っている方が、本ブログの内容を真似することで、自分のデータで解析ができる情報を提供することが目標です! 今はGATKの解説をメインテーマにしています。

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2021-06-13から1日間の記事一覧

マッピングの前準備

リファレンスゲノムのダウンロード、インデックスファイルの作成、SRAからfastqおよびfastq.gzへの変換する。 BWA index, fastq-dump, pigzの使い方。 マッピングに必要な準備としてリファレンスゲノムのダウンロード、インデックスファイルの作成、SRA形式…