2021-07-20から1日間の記事一覧
GATK HaplotypeCaller 使用難易度★★★☆☆ 本記事は、GATK解説シリーズのPart 5の前編です。 eupatho-bioinfomatics.hatenablog.com 今回は何をする？ GATK HaplotypeCallerを使って、前回の記事で得たBAM形式ファイルから、変異情報の記載されたVCFファイルを…
GATK MarkDuplicate 使用難易度★★☆☆☆ 本記事は、GATK解説シリーズのPart 4です。 eupatho-bioinfomatics.hatenablog.com 今回は何をする？ 前回の記事で得たBAM形式ファイルを使って、GATK MarkDuplicates/MarkDuplicateSparkにより重複したリードにタグを付…
